Pada 27 Mac 2013, Komšić dipilih Datuk Bandar Sarajevo.

Komšić menyertai 2013 protes JMBG di Sarajevo, dengan berkata "saya di sini juga bagi pihak lebih 1,500 bayi Sarajevo yang tidak boleh mendapatkan dokumen perjalanan."

Semasa protes dan rusuhan di seluruh Bosnia dan Herzegovina pada Februari 2014, Komšić berkata perobohan bangunan kerajaan tidak adalah jawapannya. Beliau menyatakan bahawa dia memang tahu bahawa orang-orang telah dibawa ke tepi sosial, beliau menggesa orang ramai untuk menyatakan dengan jelas tuntutan mereka secara aman.

Apabila Pope Francis melawat Bosnia dan Herzegovina pada 6 Jun 2015, Datuk Bandar Komšić dianugerahkan kepadanya Kunci anugerah City of Sarajevo.

Berikutan percubaan dan keputusan bersalah Serb penjenayah perang Radovan Karadžić pada 24 Mac 2016, Datuk Bandar Komšić menyatakan bahawa semasa ia adalah penting bahawa penghakiman itu mengesahkan tanggungjawab langsung Karadžić selama bertahun-tahun keganasan di Bosnia dan Herzegovina, dia tidak berpuas hati dengan 40 tahun ayat, berkata Karadžić perlu terima maksimum kerana keterukan jenayah. Komšić tertanya-tanya mengapa Tribunal memutuskan untuk menghadkan caj pembunuhan beramai-ramai untuk Srebrenica sahaja, kerana "Karadžić bertanggungjawab untuk kekejaman di seluruh negara." Beliau menambah, "Jika kita mengambil hanya Sarajevo kira, ia akan menjadi lebih daripada cukup untuk penjara seumur hidup."

Komšić menegaskan keinginannya untuk negaranya untuk melepasi peristiwa-peristiwa ganas abad ke-20 dan "ke dalam era baru".